Personalmente a mí me gusta RetroArch, pero sé que a mucha gente le carga porque es hueveado de configurar. Si no te molesta pasarte un rato aprendiendo a configurarlo podría ser una buena opción.
En caso que no te tinque el hueveo de RetroArch, revisando en google vi que estas son buenas opciones:
Para N64: Mupen64Plus FZ.
Para SNES: Snes9x EX+.
Todos estos se bajan desde Play Store, así que no debería haber riesgo de malware.